Sesion del 5 de febrero de 2013

Comenzamos esta sesión en la sala de ordenadores donde estuvimos comprobando los resultados de los ejercicios que teníamos pendientes. Tras ellos, recorrimos diversas dependencias del centro con la finalidad de conocer mejor como se trabaja con las secuencias de ADN, así como lo que se hace en el departamento de Microbiología del Suelo.

Seguidamente comenzamos a trabajar con los grupos de Massilia. Nos distribuimos por parejas y comenzamos nuestro trabajo, que consistía en coger todas las secuencias del grupo y alinearlas para observar las diferencias que había entre ellas y valorar si eran significativas, y por tanto había que tenerlas en cuenta, o no lo eran.

Cuando estábamos terminando encontramos algo muy interesante en uno de los grupos, concretamente el número 3. Observamos que al alinear las cinco secuencias de este grupo en todos aparecían las mismas diferencias salvo en uno; esto podía significar que podíamos tener una nueva bacteria.

Paco nos envío en un documento el Árbol Massilia en el que había ocho grupos, de los cuáles teníamos que intentar saber cómo son y qué podemos decir de ellos. En esencia tenemos que ver si las secuencias son homogéneas, si hay cambios, cómo son éstos...

Paula tras terminar de alinear los ocho grupos de Massilia, envío los siguientes resultados:

GRUPO 1:
Homogéneo: si
Cambios: si, 2 cambios reales posibles (T18A / G52A)
¿Merece la pena quedarse con el?: no
GRUPO 2:
Homogéneo: no
Cambios: si, 1 cambio real posible (G153 deleción)
¿Merece la pena quedarse con el?: no
GRUPO 3:
Homogéneo: si
Cambios: si, 4 cambios reales posibles ( deleccion G47 /deleccion T68 /G126A /G196A )
¿Merece la pena quedarse con el?: si
GRUPO 4:
Homogéneo: no
Cambios: si, 4 cambios reales posibles ( A5C /G21A /C93 deleccion /deleccion C108 )
¿Merece la pena quedarse con el?: si
GRUPO 5:
Homogéneo: si
Cambios: si, ningun cambio real posible.
¿Merece la pena quedarse con el?: no
GRUPO 6:
Homogéneo: si
Cambios: si, 1 cambio real posible (G68C)
¿Merece la pena quedarse con el?: no
GRUPO 7:
Homogéneo: si
Cambios: no
Merece la pena quedarse con el?: no
GRUPO 8:
Homogéneo: si
Cambios: no
Merece la pena quedarse con el?: no