El pasado 19 de Noviembre tuvo lugar la tercera visita a la EEZ dentro del proyecto de Bioinformática. En esta sesión profundizamos en el manejo del programa Clone Manager, acerca del cual aún teníamos algunas dudas. Es necesario desenvolvernos bien con este programa pues será nuestra herramienta principal.
También comparamos los resultados que obtenimos entre nosotros sobre el problema que teníamos planteado desde la sesión anterior.
También comparamos los resultados que obtenimos entre nosotros sobre el problema que teníamos planteado desde la sesión anterior.
Dicho problema consistía en averiguar los tamaños de las muestras de ADN
que se muestran en la imagen basándonos en una guía de tamaños de las
dos últimas filas. Al terminar de comprobar nuestros resultados, nuestro investigador nos
comentó que íbamos a trabajar principalmente con las filas 10 y 11 de
la imagen en distintas especies.
Para continuar estuvimos comparando y alineando con el programa Clone Manager varias
secuencias de E coli. Y entre algunas de esas
comparaciones estuvimos buscando las diferencias
que había entre ellas respecto a la referencia de 16sRNA-1.
También estuvimos analizando varias secuencias en una base de datos con
distintos porcentajes de fiabilidad para comprobar a que bacteria
se correspondían las secuencias con las que estábamos trabajando y
descubrimos que la secuencia que mejores resultados tendría en casi
todas las bacterias seria la F.
La tarde concluyo con la recomendación de que continuásemos trabahando con Clone Manager y con las secuencias que teníamos.
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