Lámina 4

En las bacterias, los genes que codifican los ARN ribosómicos están organizados en operones. Un operón está formado por un grupo o complejo de genes estructurales que se transcriben a ARNs a partir de una secuencia reguladora denominada promotor. Este promotor es la zona que controla el inicio de la transcripción del operon. 

Cada operón ribosómico contiene genes para los distintos tipos de ARN ribosómicos separados por regiones no codificantes denominadas resgiones espaciadoras o intergénicas. Estos genes, en el caso de los operones ribosomales, son los que codifican los ARN 23S (en la figura el gen rrl), los ARN 16S (rrs) y los ARN 5S (rrf).

Este operón contiene dos promotores, P1 y P2, situados en la región anterior al fragmento que codifica los ARN 16S. A partir de aquí se sintetiza un ARN con todos los fragmentos de ARN ribosomal que posteriormente son cortados en los tres tipos descritos mediante la ARNasa III, un enzima que corta las moléculas de ARN.

Para nosotros es de interés el ADN ribosómico 16S a partir de cuya secuencia vamos a obtener información filogenética y taxonómica sobre los distintos grupos de Massilia.

Para averiguar el tamaño de las moléculas de ADN realizamos una electroforesis.
La electroforesis es una técnica preparativa que utilizamos para purificar moléculas parcialmente antes de secuenciar ADN.
Concretamente nosotros hemos realizado una electroforesis en gel de agarosa donde aparecen varias bacterias, entre ellas Massilia, con la que hemos trabajado.